Format de fichier 3D des petites molécules et source
Les ligands ou constituants biologiques sont disponibles dans différentes bases de données, trois formats sont le plus souvent utilisés, en fonction de l’utilisation prévue du ligand :
le format SDF, attention ce format permet de représenter les molécules en 2D, il faut être vigilant à télécharger la molécule au format « 3D ». le format MOL2 le format PDB
Il existe de nombreux autres formats pour représenter les petites (...)
Peut-être ...
Mais pour cela il faut recontextualiser le problème, comprendre ce qu’est une protéine, et imaginer quelles méthodes sont mises en jeu ou devraient être développer. Pour expliquer ces concepts, j’ai rédigé un article à destination du grand public.
Dans cet article, j’ai (...)