Format de fichier 3D des petites molécules et source
Les ligands ou constituants biologiques sont disponibles dans différentes bases de données, trois formats sont le plus souvent utilisés, en fonction de l’utilisation prévue du ligand :
le format SDF, attention ce format permet de représenter les molécules en 2D, il faut être vigilant à télécharger la molécule au format « 3D ». le format MOL2 le format PDB
Il existe de nombreux autres formats pour représenter les petites (...)
Here is a short list of plugins related to protein structure analysis.
xPyder : a PyMOL plugin to analyze coupled residues and their networks in protein structures
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22721491/
Azahar : a PyMOL plugin for construction, visualization and analysis of glycan (...)