Comment exécuter facilement un programme plus rapidement sur un ordinateur moderne ?
Voici les commandes rapides pour transformer un programme monotâche en python en programme capable d’utiliser tous les processeurs de votre machine.
Programme exemple monotâche en biopython
Le code simplifié ci-dessous permet de lire l’ensemble des transcrits du transcriptome de Physarum polycephalum autrement connu sous le nom de BLOB, vous pouvez trouver une présentation sur YouTube de ce petit (…)
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28 juin 2023, par S. TéletchéaBLAST is a very powerful and widely used method for querying large sequence databases for sequence proximity with a sequence of interest. This difficult problem requires a fast algorithm designed for nucleic and protein sequences only since their alphabet is limited (5 bases for nucleotides, 21 amino acids for protein), but sequence length can be very long (more than 40000 amino). An example of BLAST installation and usage is provided below.
BLAST Installation
Basic Local Alignment (…)
Molecular Modelling and GNU/Linux