Science

Cette page recense des ressources liées au domaine de l’apprentissage profond, il s’agit d’un article en évolution constante.
Qu’est-ce qu’un transformer ?
https://ledatascientist.com/a-la-decouverte-du-transformer/
https://www.openstudio.fr/2022/02/08/fonctionnement-des-transformers-et-leurs-applications/
https://www.journaldunet.fr/web-tech/guide-de-l-intelligence-artificielle/1508983-transformer-deep-learning/
BERT (…)

A simple how-to of frequent errors made while writing an article in English (American)
Of course, since I’m French, this article will be far from being complete, so do not hesitate to correct me !
Rule 1 - Define the topic of your research publication
http://abacus.bates.edu/ ganderso/biology/resources/writing/HTWstrategy.html
Rule 2 - Start your document with well-defined sections
http://geog.arizona.edu/ comrie/geog230/report.htm (…)

Le 22 juillet dernier, les chercheurs coréens Sukbae Lee, Jihoon Kim, Hyun-Tak Kim, Sungyeon Im, SooMin An, Keun Ho Auh ont mis en ligne un article en pré-soumission (https://arxiv.org/abs/2307.12037, https://arxiv.org/abs/2307.12008) dans lequel ils affirment avoir synthétisé puis testé le premier matériau supraconducteur à haute température. Devant l’importance de cette annonce, j’ai moi aussi été curieux de savoir ce qu’il en était, tant les implications pour notre vie quotidienne sont (…)

Peut-être ...
Mais pour cela il faut recontextualiser le problème, comprendre ce qu’est une protéine, et imaginer quelles méthodes sont mises en jeu ou devraient être développer. Pour expliquer ces concepts, j’ai rédigé un article à destination du grand public.
Dans cet article, j’ai présenté les grandes lignes de l’approche de google, puis les éléments à prendre en compte pour valider s’ils ont raison, puis enfin discuté (un peu) d le l’avenir du domaine de la prédiction de structures (…)

Here is a short list of plugins related to protein structure analysis.
xPyder : a PyMOL plugin to analyze coupled residues and their networks in protein structures
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22721491/
Azahar : a PyMOL plugin for construction, visualization and analysis of glycan molecules
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27549814/
bcl::Cluster : A method for clustering biological molecules coupled with visualization in the Pymol Molecular Graphics System (…)

Cette page regroupe quelques liens remarquables ayant comme perspectives la production de composés non naturels inspirés de la nature.
Cell-free chemoenzymatic starch synthesis from carbon dioxide
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abh4049 The coming of age of de novo protein design
https://www.nature.com/articles/nature19946 PyPEF—An Integrated Framework for Data-Driven Protein Engineering
https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jcim.1c00099 Entreprises (…)